Neutrauchburg ist ein sogenanntes Expositurvikariat. Es gehört zur Kirchengemeinde St. Georg und Jakobus in Isny. Das Expositurvikariat hat keinen eigenen Kirchengemeinderat. Es war schon immer eng verbunden mit den Waldburg-Zeil-Kliniken in Neutrauchburg. In der Kirche Zum kostbaren Blut hält Klinikseelsorgerin Jeanette Krimmer regelmäßig Gottesdienste.